A nemes vonalú, pompás barokk orgonaház a templom restaurálása óta üresen áll a karzaton, a hangszer szerkezetének megmaradt roncsai sokáig az oltár alatt vártak jobb sorsra. 2003-ban Homolya Dávid Svájcban élő magyar orgonaművész és nemzetközi orgonaszakértő javaslatára az akkori plébános, Vargha Béla atya és Fórika Balázs kézdivásárhelyi kántor a hangszer roncsait konzerválta, odaadó szervezőmunkájukkal elindult a gyűjtés az orgona rekonstruálására. Bereczi István jelenlegi plébános szintén felkarolta az ügyet, és 2011 tavaszán megbízta Bors László újtusnádi orgonaépítőt a hangszer rekonstruálásával. A megújult orgonát Homolya Dávid szólaltatja meg először november 5-én, Szent Imre napján, a templom búcsúján.
A gelencei Szent Imre műemlék templom régi, tönkrement orgonáját Johannes Baumgartner (1714–1758) segesvári szász orgonaépítő mester készítette kb. 1750 és 1758 között. Az orgona bizonyosan nem jelenlegi helyére épült, de talán nem is Gelencére. A fennmaradt Baumgartner-orgonák segítségével a svájci orgonaszakértőnek sikerült minden technikai adatot megtudnia a hangszerről, és ennek alapján rekonstruálta azt. A tönkrement, szétázott szélládát visszaépítésre alkalmatlannak ítélte, ezért Bors László orgonaépítő pontos másolatot készített róla, ez kerül az új orgonába. A hangszer szerkezeti egységének legyártása, előállítása, valamint az orgonaház megerősítése állandó szakmai egyeztetés és párbeszéd mellett megtörtént. A fémsípokat Bartis Szabolcs készítette eredeti minta és ötvözet alapján. Hermann Binder az orgonaház összekarcolt oldalsó és hátsó részének restaurálásában, valamint a regiszterfeliratok elkészítésében nyújtott segítséget. A hangszert október 25-én szerelte össze Bors László. Az intonálást-hangolást Homolya Dávid személyesen irányítja majd a november 5-i szentelőt megelőző héten. Az orgonaszakértő Bereczi István gelencei plébánosnak írt levelében azt hangsúlyozza: "rendkívüli jelentőségű munka megy végbe, és rendkívüli jelentőségű orgona épül Gelencén. Itt nem egyszerű orgonaépítésről van szó, hanem annál sokkal többről. Mind szakmailag, mind kulturális értelemben úttörő cselekedet, hogy egy régi hangszert tudományos módszerekkel és igényesen újjáépítenek. Ez a hangszer gyakorlatilag a már nem létező gelencei orgona hasonmása lesz, hangjára ugyanúgy repülünk vissza az időben évszázadokat, mintha az eredeti hangszert hallgatnánk. Ha úgy tetszik, »klónozzuk« Baumgartner 260 éves orgonáját." Szerinte eddig ilyen rekonstrukció nem történt még sem Er­délyben, sem Magyar­orszá­gon. "Ahogy Gelence visszakapta a betakart Szent László-freskókat, úgy most visszakapja a régen elpusztult ékszer-orgonáját, mely eme kivételes gyöngyszemnek számító magyar templom ódon fényét méltóképpen emeli" – áll a levélben.