A visszavágón is fölényesen győzte le a Valencia a Rapid Wient, és 10–0-s összesítéssel jutott be az Európa-liga legjobb 16 csapata közé, így csúcsot döntött a 2009–2010-es idénytől létező kiírásban. Az ukrán Sahtar Donyeck a 32 között rendezett párharc visszavágóján 3–0 arányban legyőzte a német Schalke csapatát. A német klubok közül az Augsburg is búcsúzott, mivel a hazai 0–0 után idegenben 1–0-ra kikapott a Liverpooltól, azonban a Bayer Leverkusen a portugál Sporting kettős legyőzésével nyolcaddöntős.
Az angol klubok közül a Manchester United és a Tottenham is ott lesz a legjobb 16 között. Eredmények: Braga–Sion 2–2 (összesített eredmény: 4–3), Lokomotiv Moszkva–Fenerbahce 1–1 (1–3), Man. United–Midtjylland 5–1 (6–3), Tottenham–Fiorentina 3–0 (4–1), Porto–Dortmund 0–1 (0–3), Olympiakosz–Anderlecht 1–2 (1–3), Molde–Sevilla 1–0 (1–3), Napoli–Villarreal 1–1 (1–2), Basel–Saint-Étienne 2–1 (4–4 – továbbjutott a Basel idegenben szerzett több góllal), Bayer Leverkusen–Sporting 3–1 (4–1), Rapid Wien–Valencia 0–4 (0–10), Liverpool–Augsburg 1–0 (1–0), FK Krasznodar–Sparta Praha 0–3 (0–4), Lazio–Galatasaray 3–1 (4–2), Schalke–Sahtar 0–3 (0–3), Athletic Bilbao–Marseille 1–1 (2–1). (miska)
