Nyonban a Bajnokok Ligája és az Európa-liga első és második selejtezőkörének sorsolásával kezdetét vette a 2016–2017-es európai kupaidény.
A Ferencváros az albán bajnok Skënderbeut kapta, idegenben kezd július 12-én vagy 13-án, ha nem zárják ki az albánokat, akiknek felfüggesztett kizárásáról július 5-én vagy 6-án dönt a nemzetközi Sportdöntőbíróság. Kizárás esetén a Partizani Tirana ugorhat be a Skënderbeu helyére. Az Európa-liga első selejtezőkörének sorsolásánál kiderült, hogy a Videoton a moldovai Zaria Balti ellen kezd otthon, a Debrecen a San Marinó-i La Fiorita otthonában, az MTK pedig a kazah Aktobe vendégeként rajtol. A második körben a fehérváriak szerb vagy kazah, a debreceniek fehérorosz, a fővárosiak pedig azeri vagy grúz csapattal találkozhatnak. Az El első fordulójának első meccseit június 30-án, a visszavágókat július 7-én játsszák, a 2. forduló első meccseinek időpontja július 14., a visszavágóké július 21.
A BL 1. fordulójának párosítása: Flora (észt)–Lincoln Red Imps (gibraltári) – 1. párharc, The New Saints (walesi)–Tre Penne (San Marinó-i) – 2. párharc, Valletta FC (máltai)–B36 Tórshavn (feröeri) – 3. párharc, FC Santa Coloma (andorrai)–Alaskert (örmény) – 4. párharc. Az első mérkőzéseket június 28–29-én, a visszavágókat július 5–6-án játsszák. Az első meccset az elöl álló csapat játssza otthon.
A BL 2. fordulójának párosítása: Skënderbeu (albán)–Ferencváros, az első selejtezőkör 2. párharcának továbbjutója–APOEL (ciprusi), Zrinjski Mostar (bosznia-hercegovinai)–Legia Warszawa (lengyel), Ludogorec (bolgár)–Mladoszt Podgorica (montenegrói), Dinamo Tbiliszi (grúz)–az első selejtezőkör 4. párharcának továbbjutója, Zalgiris Vilnius (litván)–Asztana (kazah), BATE Boriszov (fehérorosz)–SJK (finn), az első selejtezőkör 3. párharcának továbbjutója–Crvena zvezda (szerb), Rosenborg (norvég)–IFK Norrköping (svéd), Dundalk (ír)–FH (izlandi), az első selejtezőkör 1. párharcának továbbjutója–Celtic (skót), Crusaders (északír)–FC Köbenhavn (dán), Qarabag (azeri)–F91 Dudelange (luxemburgi), Hapoel Beer-Seva (izraeli)–Sheriff (moldovai), Olimpija Ljubljana (szlovén)–Trencín (szlovák), Salzburg (osztrák)–Liepaja (lett), Vardar (macedón)–Dinamo Zagreb (horvát).
Az első mérkőzéseket július 12–13-án, a visszavágókat július 19–20-án játsszák. Az első meccset az elöl álló csapat játssza otthon.
