A tej fizikai tisztasága a fejés és tejkezelés higiéniájának egyik fontos mutatója. Mielőtt a gyűjtőedénybe öntjük, a tejet meg kell szűrni. A fejés vagy kezelés ideje alatt belekerülő szalma, por, takarmányrészek, szőrök csak szűréssel távolíthatóak el.
A szűrés azonban szükséges rossz, mert csak a durvább szennyeződéseket fogja fel, míg a tejben összetapadt mikrobákat még jobban szétválasztja és elosztja a tej tömegében. A szűrés tehát bakteriológiai szempontból nem javítja a tejet. Többféle szűrőt használhatunk, de az érvényben levő állat-egészségügyi és állattenyésztési előírások értelmében tilos a műanyag szűrők használata. Eléggé jónak mondhatók a szűrőkendők, de elengedhetetlenül szükséges rendszeres cserélésük, tisztán tartásuk és szagmentesítésük. A használt szűrőruhát először hideg vízben kell alaposan kiöblíteni, majd utána zsíroldó hatású tisztítószerrel kifőzni. Előzetes öblítés nélkül nem szabad forró vízben mosni, mivel a hő hatására kicsapódó tejfehérje eltömi a kelme rostjait, és nehezen távolítható el.
A tej hűtése a szakszerű higiénia, tehát a tejkezelés alapja. A tejnek összetett és jól észlelhető csíragátló-csírapusztító hatása van. A fejés után egy ideig az összcsíraszám nem emelkedik, sőt, némelykor csökken (baktericid fázis). A csíragátlást, illetve -pusztítást a tejben eredendően megtalálható különböző specifikus anyagok, enzimek okozzák. A baktericid szakasz időtartama a nem hűtött tejben a fejés után két-három óra, ami akár 24—48 órára is megnyújtható, ha a hűtés a fejés után közvetlenül megtörténik, és a tej hőmérséklete 4—5 Celsius-fok alá csökken. Hűtés nélkül azonban a meleg tejben a baktériumok egy-két óra múlva gyors ütemben szaporodni kezdenek, és veszélyeztetik a tej minőségét. Ha nincs lehetőségünk idejében 4—5 fokra hűteni, a baktériumtevékenységet mérsékelhetjük 8—10 Celsius-fokra történő hűtéssel. A 3—4 Celsius-fok alá hűtés nem ajánlatos a család fogyasztására szánt tej esetében, mivel forraláskor hamarabb kozmásodik.
Még ma is eléggé elterjedt a vízbe állított kannákban való hűtés, de csak lassú hűlést lehet vele elérni. A korszerű mélyhűtő gépekhez cseppfolyós szénsavat vagy ammóniagázt használnak a gyors és nagy teljesítményű hűtéshez. A tej hűtését ajánlatos az istállótól teljesen különálló helyiségben, a tejkamrában végezni.
